月餅在古時一般只以布裹，使用紙盒包裝是到了20世紀因為月餅被商品化才出現。由於衛生的考慮，現代月餅通常都會用透明塑膠袋作獨立包裝,在台灣，月餅並不只在中秋時食用（外地傳入之月餅除外），各類台式月餅如蛋黃酥和綠豆椪即使在非中秋時節仍可能買得到，就如一般糕餅一樣。

月餅的餅餡一般分為軟硬兩種，軟餡中含水分較多，只能儲存7到10天左右，而硬餡月餅則可儲存1個月左右。盒裝月餅，應將盒蓋開啟，使其通風。另外，因月餅中含脂肪較多，存放時還應注意避光，以防油脂氧化月餅含有豐富的油脂和糖分，受熱受潮都極易發霉、變質，所以一定要將月餅存放在低溫、陰涼、通風的地方。一般來說，月餅皮軟、水分大、易變質，最好將月餅連帶包裝盒一起放入冰櫃冷藏室，食前一小時取出，可保證它的口味。月餅存放時，不宜與其他食品、雜物放在一起，以免串味，失去應有的口味和特色。